Nació en Amozoc, Puebla, el 12 de marzo de 1812. Fue presidente interino de México del 11 de diciembre de 1855 al 30 de noviembre de 1857, y constitucional del 1 al 17 de diciembre de 1857.
Murió en Molino de Soria, Guanajuato, el 13 de noviembre de 1863.
Realizó sus estudios en la capital poblana. Combatió a los estadunidenses en 1847 y participó en la Batalla de Churubusco.
En marzo de 1854, junto con el general Juan Ãlvarez, encabezó la Revolución de Ayutla, que significó la caÃda definitiva de Antonio López de Santa Anna.
Liberal moderado, cuando llegó a la Presidencia formó un gabinete mixto â??de liberales y conservadoresâ?? difÃcil de controlar. Enfrentó diversas rebeliones encabezadas por el clero, que se oponÃa a la implantación de leyes reformistas.
Inicialmente apoyó la creación de la Constitución liberal de 1857, a la que terminó por desconocer mediante un autogolpe de Estado que dio origen a la Guerra de Reforma. El 21 de enero de 1858 partió al exilio.
En 1861 regresó a México. Con la Intervención francesa en ciernes, Comonfort y Juárez limaron asperezas.
En octubre de 1863 fue nombrado ministro de Guerra y general en jefe del ejército que se trataba de organizar para enfrentar a los invasores
